El Servicio de Anatomía Patológica dirigido por el Dr. Francesc Alameda realiza diversas técnicas diagnósticas para confirmación histológica de los preparados. Entre otros, se utilizan anticuerpos inmunorreactivos y tinciones histoquímicas para el diagnóstico de la displasia cortical focal (FCD), esclerosis del hipocampo y el diagnóstico diferencial de los tumores cerebrales relacionados con epilepsia.